Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx17Q8BVL3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx17Q8BVL3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snx17Q8BVL3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx17Q8BVL3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx17Q8BVL3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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