Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lrp12Q8BUJ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp12Q8BUJ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrp12Q8BUJ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrp12Q8BUJ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms