Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6kb1Q8BSK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6kb1Q8BSK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6kb1Q8BSK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rps6kb1Q8BSK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rps6kb1Q8BSK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms