Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf18Q8BM39 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf18Q8BM39 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf18Q8BM39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf18Q8BM39 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms