Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarsl2Q8BLY2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarsl2Q8BLY2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tarsl2Q8BLY2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarsl2Q8BLY2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarsl2Q8BLY2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms