Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prox2Q8BII1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prox2Q8BII1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prox2Q8BII1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prox2Q8BII1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prox2Q8BII1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms