Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmco3Q8BH01 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmco3Q8BH01 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmco3Q8BH01 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmco3Q8BH01 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms