Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Necab1Q8BG18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Necab1Q8BG18 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Necab1Q8BG18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Necab1Q8BG18 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Necab1Q8BG18 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Necab1Q8BG18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms