Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATAD2AQ86YP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATAD2AQ86YP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATAD2AQ86YP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GATAD2AQ86YP4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms