Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM50Q86XT4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM50Q86XT4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM50Q86XT4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM50Q86XT4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM50Q86XT4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM50Q86XT4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM50Q86XT4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM50Q86XT4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM50Q86XT4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM50Q86XT4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms