Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Amigo1Q80ZD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Amigo1Q80ZD8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Amigo1Q80ZD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Amigo1Q80ZD8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Amigo1Q80ZD8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Amigo1Q80ZD8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms