Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW2

Fbxo2, F-box only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo2Q80UW2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbxo2Q80UW2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fbxo2Q80UW2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fbxo2Q80UW2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo2Q80UW2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxo2Q80UW2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo2Q80UW2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms