Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP1Q7Z6B7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP1Q7Z6B7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP1Q7Z6B7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP1Q7Z6B7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SRGAP1Q7Z6B7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRGAP1Q7Z6B7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRGAP1Q7Z6B7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms