Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDXQ7Z353 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDXQ7Z353 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDXQ7Z353 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDXQ7Z353 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDXQ7Z353 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDXQ7Z353 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDXQ7Z353 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDXQ7Z353 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDXQ7Z353 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDXQ7Z353 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HDXQ7Z353 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms