Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rexo1Q7TT28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rexo1Q7TT28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rexo1Q7TT28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rexo1Q7TT28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rexo1Q7TT28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rexo1Q7TT28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rexo1Q7TT28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rexo1Q7TT28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rexo1Q7TT28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rexo1Q7TT28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rexo1Q7TT28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rexo1Q7TT28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rexo1Q7TT28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rexo1Q7TT28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rexo1Q7TT28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rexo1Q7TT28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rexo1Q7TT28 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rexo1Q7TT28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms