Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clec18aQ7TSQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec18aQ7TSQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec18aQ7TSQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms