Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LnpkQ7TQ95 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LnpkQ7TQ95 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LnpkQ7TQ95 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LnpkQ7TQ95 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LnpkQ7TQ95 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms