Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmc8Q7TN58 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmc8Q7TN58 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmc8Q7TN58 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmc8Q7TN58 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmc8Q7TN58 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmc8Q7TN58 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms