Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCXQ7RTU7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCXQ7RTU7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCXQ7RTU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCXQ7RTU7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCXQ7RTU7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCXQ7RTU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCXQ7RTU7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCXQ7RTU7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCXQ7RTU7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms