Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4bQ7M729 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4bQ7M729 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4bQ7M729 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn4bQ7M729 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn4bQ7M729 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4bQ7M729 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn4bQ7M729 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms