Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP1BQ7LBR1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP1BQ7LBR1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP1BQ7LBR1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP1BQ7LBR1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms