Protein–RNA interactions for Protein: Q7L523

RRAGA, Ras-related GTP-binding protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGAQ7L523 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRAGAQ7L523 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRAGAQ7L523 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRAGAQ7L523 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRAGAQ7L523 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRAGAQ7L523 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms