Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh1Q76I79 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ssh1Q76I79 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ssh1Q76I79 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ssh1Q76I79 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh1Q76I79 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ssh1Q76I79 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms