Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP43Q70EL4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP43Q70EL4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP43Q70EL4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms