Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms