Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYDE1Q6ZW31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE1Q6ZW31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE1Q6ZW31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms