Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND5BQ6ZUT9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms