Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC149Q6ZUS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC149Q6ZUS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC149Q6ZUS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC149Q6ZUS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms