Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C15orf39Q6ZRI6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C15orf39Q6ZRI6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C15orf39Q6ZRI6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C15orf39Q6ZRI6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C15orf39Q6ZRI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C15orf39Q6ZRI6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C15orf39Q6ZRI6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C15orf39Q6ZRI6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C15orf39Q6ZRI6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C15orf39Q6ZRI6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms