Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nemp1Q6ZQE4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nemp1Q6ZQE4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nemp1Q6ZQE4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nemp1Q6ZQE4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms