Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg5Q6ZPY2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg5Q6ZPY2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg5Q6ZPY2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg5Q6ZPY2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms