Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF111Q6ZNA4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF111Q6ZNA4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF111Q6ZNA4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF111Q6ZNA4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms