Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00114Q6XXX2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00114Q6XXX2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00114Q6XXX2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00114Q6XXX2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00114Q6XXX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00114Q6XXX2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00114Q6XXX2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms