Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ift172Q6VH22 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ift172Q6VH22 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift172Q6VH22 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ift172Q6VH22 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ift172Q6VH22 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ift172Q6VH22 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ift172Q6VH22 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ift172Q6VH22 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ift172Q6VH22 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ift172Q6VH22 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ift172Q6VH22 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ift172Q6VH22 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ift172Q6VH22 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ift172Q6VH22 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ift172Q6VH22 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift172Q6VH22 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Ift172Q6VH22 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ift172Q6VH22 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift172Q6VH22 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ift172Q6VH22 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ift172Q6VH22 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ift172Q6VH22 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift172Q6VH22 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift172Q6VH22 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift172Q6VH22 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms