Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdk2Q6V4S5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdk2Q6V4S5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdk2Q6V4S5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdk2Q6V4S5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdk2Q6V4S5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdk2Q6V4S5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdk2Q6V4S5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sdk2Q6V4S5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdk2Q6V4S5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdk2Q6V4S5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdk2Q6V4S5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdk2Q6V4S5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms