Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRSAM1Q6UWE0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRSAM1Q6UWE0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRSAM1Q6UWE0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms