Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C16orf54Q6UWD8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C16orf54Q6UWD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C16orf54Q6UWD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms