Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tcaf3Q6QR59 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tcaf3Q6QR59 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tcaf3Q6QR59 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcaf3Q6QR59 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tcaf3Q6QR59 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tcaf3Q6QR59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms