Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
APOA5Q6Q788 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
APOA5Q6Q788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
APOA5Q6Q788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
APOA5Q6Q788 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOA5Q6Q788 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 562.7 ms