Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp2b4Q6Q477 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp2b4Q6Q477 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp2b4Q6Q477 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp2b4Q6Q477 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp2b4Q6Q477 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atp2b4Q6Q477 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp2b4Q6Q477 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp2b4Q6Q477 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp2b4Q6Q477 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp2b4Q6Q477 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp2b4Q6Q477 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp2b4Q6Q477 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp2b4Q6Q477 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms