Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK3Q6PHR2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK3Q6PHR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK3Q6PHR2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms