Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rad54bQ6PFE3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad54bQ6PFE3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad54bQ6PFE3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rad54bQ6PFE3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad54bQ6PFE3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms