Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrm2bQ6PEE3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrm2bQ6PEE3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrm2bQ6PEE3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrm2bQ6PEE3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrm2bQ6PEE3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrm2bQ6PEE3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrm2bQ6PEE3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrm2bQ6PEE3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrm2bQ6PEE3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrm2bQ6PEE3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms