Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q6P435 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q6P435 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q6P435 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q6P435 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q6P435 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q6P435 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q6P435 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q6P435 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Q6P435 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6P435 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6P435 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6P435 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6P435 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6P435 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6P435 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q6P435 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q6P435 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q6P435 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6P435 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6P435 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6P435 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6P435 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6P435 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6P435 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6P435 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6P435 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6P435 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6P435 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6P435 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6P435 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6P435 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6P435 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6P435 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6P435 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6P435 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q6P435 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q6P435 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q6P435 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q6P435 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q6P435 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q6P435 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6P435 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6P435 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6P435 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6P435 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6P435 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6P435 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6P435 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6P435 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6P435 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6P435 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6P435 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6P435 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6P435 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6P435 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6P435 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6P435 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6P435 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6P435 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6P435 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6P435 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6P435 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6P435 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6P435 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q6P435 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q6P435 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q6P435 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q6P435 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6P435 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6P435 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6P435 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6P435 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6P435 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6P435 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6P435 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6P435 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6P435 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6P435 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6P435 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6P435 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6P435 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6P435 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6P435 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6P435 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6P435 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6P435 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6P435 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6P435 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q6P435 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q6P435 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6P435 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6P435 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6P435 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6P435 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6P435 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6P435 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6P435 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6P435 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6P435 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms