Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo3Q6P2B1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo3Q6P2B1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo3Q6P2B1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo3Q6P2B1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms