Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CC2D1AQ6P1N0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1AQ6P1N0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CC2D1AQ6P1N0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D1AQ6P1N0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms