Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rad17Q6NXW6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Rad17Q6NXW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rad17Q6NXW6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rad17Q6NXW6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rad17Q6NXW6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rad17Q6NXW6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rad17Q6NXW6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rad17Q6NXW6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rad17Q6NXW6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rad17Q6NXW6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rad17Q6NXW6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rad17Q6NXW6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rad17Q6NXW6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rad17Q6NXW6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Rad17Q6NXW6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rad17Q6NXW6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rad17Q6NXW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rad17Q6NXW6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rad17Q6NXW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rad17Q6NXW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rad17Q6NXW6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rad17Q6NXW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms