Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3F3CQ6NXT2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3F3CQ6NXT2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3F3CQ6NXT2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3F3CQ6NXT2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms