Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Wdr44Q6NVE8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Wdr44Q6NVE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Wdr44Q6NVE8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Wdr44Q6NVE8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Wdr44Q6NVE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Wdr44Q6NVE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Wdr44Q6NVE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Wdr44Q6NVE8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdr44Q6NVE8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdr44Q6NVE8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdr44Q6NVE8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdr44Q6NVE8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdr44Q6NVE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdr44Q6NVE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdr44Q6NVE8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdr44Q6NVE8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdr44Q6NVE8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdr44Q6NVE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdr44Q6NVE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wdr44Q6NVE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wdr44Q6NVE8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms