Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC8EQ6NSJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8EQ6NSJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms